Вышла официальная инструкция по обновлению дистрибутивов Cinnamon и MATE с Linux Mint 18 до 18.1.

Как пишет Клемент Лефевр (основатель Linux Mint) в аннотации к обновлению: "Если ничего не сломалось, не исправляй". Иными словами, если система Linux Mint 18 у вас работала стабильно, без сбоев и не было замечено ни каких ошибок, то не стоит обновлять систему, т.к. Linux Mint 18, 18.1, 18.2 и 18.3 будут одинаково получать обновления безопасности до 2021 года.

Но если вы решили по каким-то причинам обновить систему, необходимо для этого выполнить следующие шаги.

1. Откройте Менеджер обновлений и нажмите на кнопке Проверить обновления. Если в менеджере отобразятся какие-то обновления, нажмите - Установить обновления.

2. Далее, для обновления до Linux Mint 18.1, в меню Менеджера обновлений - Правка, где вы должны увидеть строку - Обновить до Linux Mint 18.1 "Serena":
 

3. Нажмите на этой строке для подтверждения, а затем  Установить обновления и следуйте инструкциям на экране:
  После завершения обновления, перезагрузите компьютер, чтобы начать пользоваться Linux Mint 18.1 "Serena" после нового входа в систему.

Источник: http://blog.linuxmint.com

Удачи.